Apotin tiedot ovat käytössä myös valtakunnallisesti Kanta-palvelujen kautta

Apotti-järjestelmä on läpäissyt sosiaali- ja terveydenhuollon tietojärjestelmien sertifiointiprosessin. Sertifiointi sisältää yhteistestauksen ja tietoturvallisuuden arvioinnin, ja sen lopputuloksena Apotti on todettu Kanta-yhteensopivaksi.

Kantaan liittymisen keskeisenä tarkoituksena on mahdollistaa asiakas-, potilas- ja reseptitietojen hyödyntäminen yli organisaatiorajojen. Kannan avulla Apotissa kirjattuja tietoja voidaan tarkastella esimerkiksi yksityisellä terveysasemalla tai muissa sairaanhoitopiireissä, jos potilas on antanut tähän suostumuksensa.

Kanta-yhteistestauksen viimeistä vaihetta eli ristiintestausta tehtiin muun muassa Kymenlaakson sairaanhoito- ja sosiaalipalvelujen kuntayhtymän Carean kanssa heidän käyttämäänsä tietojärjestelmää vasten. Apotti suorittaa vielä käyttöönottokokeet tuotantoympäristössä sekä sähköiselle lääkemääräykselle että potilastiedon arkistolle, ja niiden onnistuneen suorituksen jälkeen Kela antaa lopullisen luvan Apotin tuotantokäytön aloitukselle.